Wnętrze cerkwi dzieli się zwykle na trzy części: przedsionek, część główną i ołtarz. Ołtarz jest najświętszym miejscem świątyni. To tam dokonuje się cud zastosowania chleba i wina do Ciała i Krwi Jezusa Chrystusa.
W cerkwi ołtarz oddzielony jest od głównej sali dla wiernych ścianą z ikonami, zwaną ikonostasem. Sam ołtarz zajmuje mniejszą powierzchnię niż główna część świątyni, w której odprawiają nabożeństwa wierni. Ponieważ ołtarz jest najświętszym miejscem świątyni, wstęp do niego mają tylko duchowni i osoby posiadające specjalne błogosławieństwo od hierarchii.
Pośrodku ołtarza znajduje się święty tron. To na nim sprawowany jest sakrament Eucharystii podczas liturgii Bożej. Kapłan podczas nabożeństwa stoi przed ołtarzem. Na samym tronie znajdują się krzyże ołtarzowe, ewangelia, antymension, a także tabernakulum i lampka na ikony. Tabernakulum zawiera suszone święte dary do komunii wierzących w domu.
W północnej części ołtarza cerkwi znajduje się ołtarz. To na nim kapłan wykonuje proskomedia, przygotowuje chleb i wino do sakramentu Eucharystii. W pewnym momencie liturgii na tron przenosi się jeszcze niekonsekrowany chleb i wino.
Integralną częścią ołtarza prawosławnego jest siedmioramienny kandelabr znajdujący się za ołtarzem bliżej wschodniej części. Świecznik siedmioramienny to konstrukcja składająca się z siedmiu ikon lamp lub świec. Jeśli siedmioramienny świecznik jest mały, można go umieścić na samym tronie. Podobny przedmiot znajdował się jeszcze w ołtarzu tabernakulum starotestamentowego.
Wschodnią ścianę ołtarza zdobi ikona Chrystusa Zbawiciela. Najczęściej święty obraz przedstawia Zmartwychwstanie Jezusa Chrystusa. Ta część ołtarza nazywana jest wyżyną. Przed ikoną Zbawiciela wisi najczęściej ikona lampy, a na najwyższym miejscu znajduje się miejsce na siedzenie duchownego.
W południowej części ołtarza najczęściej urządza się miejsce na kadzielnicę. Może być też kuchenka elektryczna, na której ministrant może rozpalić węgiel do kadzielnicy.
Ołtarz może również zawierać grobowce z całunem Jezusa Chrystusa i Najświętsze Bogurodzicy. Konkretną lokalizację tych sanktuariów wskazuje opat świątyni.
Należy zauważyć, że wnętrze ołtarza ozdobione jest różnymi ikonami lub malowidłami ściennymi. Fabuły obrazów i świętych obrazów mogą być różne. Czasem są to wydarzenia z historii Nowego Testamentu, innym razem twarze świętych, aniołów czy Matki Bożej.
